Para hacerlo funcionar tienes, como dices que has hecho, desactivar el lpt1 de placa base y en el puerto paralelo si es posible ponerlo, asi si tiene conmutadores selecciona puerto 1.

Un sistema de trabajo, al arrancar el sistema hay un momento que se ve los puertos serie, paralelo, discos, ... mira alli el puerto antes de desactivarlo (y su direccion), una vez desactivado no debe haber puerto paralelo, entonces pincha el comprado y mira si coincide el numero.

Podria ser que no haya cogido bien el modo del puerto paralelo, hay 3 o cuatro tipos y tal vez el paralelo que compras no los tenga y no admita al modo.

El lpt1 creo que normalmente es 378 y irq 7

Un comentario mas: me parece raro que se te haya dañado el puerto por haberlo conectado con el deco encendido, digamos que yo siempre lo conecto asi, aunque si he leido algun otro caso de quemarse el puerto.