No se si me he enterado pero creo que lo que tienes es un menú desplegable y quieres que al pulsar sobre alguna de las opciones salga una nueva ventana del explorer, ¿no?
¿Qué programa usas para hacer las páginas?
En cualquier caso, puedes editar tu web con el notepad y poner lo siguente en todos los sitios donde quieres poner un enlace de modo que habra otra ventana del explorer:
Es decir, poner eso de target="_blank".
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