Hola maf776
Por lo que comentas una de 2 o el disco esta roto "sectores defectuosos" o prueba a hacer esto: guardas lo que tengas de la unidad que tienes problemas a otro disco y una vez limpio desde mipc coges y formateas la unidad. luego vuelve a pasar los datos que tenias, a ver si te sigue dando el problema.

De todas formas creo que windows tiene en algun sitio una pestaña donde le puedes kitar la opcion del scandisk cuando arranca.

Espero haberte ayudado.
Salu2