EDAN, no se que decirte, a mi me funciona el 100% de las veces. Yo uso un jtag fabricado por mi, que incorpora unas pequeñas modificaciones y no tengo problema alguno.

El unico campo de la configuracion que deberias tocar para hacer pruebas es el JtagDelay, pero te reitero que a mi me funciona le ponga el valor que le ponga.
Los otros valores de la configuracion son para configurar las lineas del puerto paralelo con el jtag, verifica que tu jtag coincida con el que acompaña al programa, si los pines concuerdan no debes de cambiar nada del resto de la configuracion.

Intenta hacer las conexiones lo mas cortas posibles.

Un saludo