A ver, no es que haya discrepancias. En teoría valen los dos sitios. Resulta que en las versiones más antíguas de ProgDVB no existía una carpeta plugins y todo se tenía que poner en el directorio raíz de la aplicación.

Luego, en favor de mejorar la organización de los ficheros, los creadores del programa incluyeron la carpeta plugins para colocar allí esos archivos. Para mantener un poco la compatibilidad con las versiones anteriores, el programa admite también que los ficheros de los plugins los puedas poner en el raíz, tal y como se hacía antes.

Yo en concreto, lo dejo todo en el raíz, por la costumbre que traía de las versiones viejas, pero ponlo donde más rabia te dé.

Un saludo