ferix pues si que puede ser una muy buena solucion lo de fraccionar por sectores el flasheo. Esta tade he estado fabricandome el ultimo Jtag que pusiste en el qtvflasher, y tambien me pasa lo mismo. Me da que esta placa hace algo al puerto de serie o lo corta por algo, puesto que cuando se me corta el Flasheo, muchas veces tengo que apagar el PC un ratito, si no, no me detecta nada.
Cuando dispongas de alguna version del Flasher por sectores para Linux, la cuelgas y pruebo haber si de esta forma soluciono esto.

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