Esa es la típica duda que tenemos todos en nuestros inicios, jejeje.
Los cables puerto de serie de 9 pines les hay normales y cruzados (null modem), según que deco queramos actualizar utiliza uno u otro, pero para nuestro deco utilizamos el cruzado (null modem).
Con el adaptador usb a puerto de serie + cable null modem te vale para actualizar sin problemas.
Si dices que te asigna puerto COM3 pues a la hora de cargar el alumiupg2 seleccionas COM3 y ya está. Recuerda que has de tener el deco apagado del interruptor trasero hasta que el aluminiupg2 esté testeando la conexion.

Espero haberte servido de ayuda
Saludos y suerte