Prueba a formaearlo por otro sistema que no sea el CD de Windows, bien con Partition Magic u otros.
También puedes ponerlo como segundo disco y formatearlo desde el mismo Windows. Así al menos sabrás si te lo formatea bien. Luego ya instalarás el sistema operativo.

Saludos.

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[FONT="Comic Sans MS"][SIZE="3"]Es más fácil engañar a la gente, que convencerlos que han sido engañados[/SIZE][/FONT]
[FONT="Tahoma"][SIZE="2"]Mark Twain[/SIZE][/FONT]