Hola, creo que tal y como tienes ahora la situación, tu solucion pasa por localizar el numero de mando (el que era antes de tu padre y ahora es tuyo) en la memoria del receptor de la puerta de tu padre y darlo de baja.

Si no sabes el numero de ese mando o la memoria esa no se puede borrar "uno a uno" deberas borrarla completamente y luego dar de alta ahi los mandos de tu padre siempre con el boton correspondiente.Con eso ese mando solo funcionaria en la tuya y en la de tu padre solo los de el.

Espero que lo arregles.
Un saludo