Efectívamente, ahí estaba el problema, la partición del HDD interna, con un nombre y la del HDD externa con otro, bien, todo igual, cuando me pedía lo del volúmen, he puesto el nombre de la partición (completo) y, comenzado la conversión, la interna (al estar vacía) rapidísima, la otra, ha tardado unos 7-8 minutos, pero me ha respetado los 90GBs aporx. q tengo, lo sorprendente es q no me ha pedido reiniciar, por todo lo leído sobre el tema, se dice q había q reinciar para q reconociera la conversión, pero yo sin reiniciar, me he situado sobre cada una de ellas y ya pone NTFS, en ambas, con todo, voy a reiniciar.
Gracias por vuestra ayuda.