Me imagino que tienes Windows 98, ¿no?
Normalmente cuando se inserta un cd en la unidad lectora el sistema operativo lo reconoce y ejecuta el programa que cree oportuno (si es un cd de audio abrirá el reproductor, por ejemplo). Eso es la "ejecución automática". En caso de estar seleccionada realizará esa operación. Y si no está seleccionada, pues no hará nada.
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