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si la información está muy fragmentada da igual que lo uses en Windows o en Linux, haría falta desfragmentarla para agilizar el acceso a ese disco.
Cuando se graba un fichero en un disco se hace en trocitos llamados clusters cuyo tamaño va de desde 1 Kb a 32 Kb (en potencias de 2, e incluso a veces podría ser mayor). En un principio todos esos trocitos están grabados de forma contiguos, por lo que se obtiene el mayor rendimiento al disco. Pero conforme se va grabando cosas en el disco y luego borrando se van creando huecos, y el próximo archivo, en vez de irse directamante al final de la zona usada intenta rellenar los huecos, por lo que el fichero está repartido por muchas partes del disco, obligando que cuando lo queramos leer se debe mover el cabezal a una pista y leer unos cuantos sectores, luego moverlo a otra pista y leer mas sectores, luego a otra pista etc. etc., disminuyendo así su rendimiento independientemente del sistema operativo usado.
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