Mis consejos

1º - No cambies muebles de su sitio una vez roomba haya empezado la limpieza
2º - No la "guíes" ni la cambies de sitio
3º - Si quieres que limpie 3 habitaciones, pon la base de carga en la 1ª o 3ª habitación, nunca en la habitación central que comunica a las otras dos.

OJO: Si está limpiando y pulsas el botón CLEAN, estás pausando a la roomba, realmente no la estás apagando del todo. Cuando le vuelves a dar a CLEAN ella cree que sigue en el mismo sitio donde lo dejó. Si quieres que olvide ese punto, debes ponerla en la base unos segundos, así resetea el modo de limpieza que llevaba.

Cuando dices que pusiste la roomba para hacer la segunda mitad de la casa, ¿cambiaste también la base de carga a esa segunda mitad? No sé, pero intuyo que roomba detectó la base de carga detrás de una pared virtual (o de ladrillos) y quería irse hacia ese lado en lugar del otro. Me ha pasado algo parecido colocando un faro detrás de un tabique, y la roomba se creía era GHOST intentando atravesar el tabique