Visto lo visto decidete y borra todo lo que recuperaste mal y metiste en tu disco duro interno y así tendrás sitio.

Luego recupera otra vez.

Si usas el Ontrack Easy Recovery, usado en la pestaña de recuperacion de 'datos', recupera bastante bien ficheros tras el formateo ya que tiene una opción específica para hacerlo y no saca muchos ficheros fantasmas.
Pero si con esa no te ha funcionado también puedes recuperar como 'ficheros' en lugar de datos y te permitirá recuperar los tipos más habituales.

Como te dice Sabito hay algun recuperador que te reconstruye la estructura original y no necesitarías pasarlo al disco interno, pero no recuerdo cuál.
Alguién si se acuerda ?

Suerte