Wenas Piolinso, ante todo darte las gracias por intentar probar lo que sugerí del puerto serie (lastima que yo ahora mismo no pueda probarlo)

Te comento, los pasos mas o menos los haces bien, aunque el problema que te da el PCLoader de que "la trama de datos recibida por parte del deco es inválida" puede ser a que lo primero que hace el programa sea comparar el "ID" del deco con el que queremos meterle para dejarnos o no.
Si te fijas en el s2pl.exe por defecto lo convierte a "01410106" que es el que utilizan los Polacos, por eso sugería que cambiases ese 41 por el 55 de tu nuevo 4410 (prueba convirtiéndolo a 0x01550106 a ver si hay suerte)

Pero para estar mas seguros te recomendaría que ejecutases un sniffer de puerto serie al mismo tiempo que el PCLoader para ver que respuestas da el deco en el proceso.

A los polacos les sale así mas o menos:

Trace du LOADER L454
UPDATE_ID : 0x01410106
Checksum Loader : 0xb48aecf4
Resultat du Chargement : 0
LDLOG_Calcul_Checksum
ff800000 ffca16e7
Init Checksum
Fin du calcul modulo 4
Checksum : 0x2781b745
LDLOG_End_Loader

Mas cosas, si el problema es de conexión prueba con poner Bits de Stop a 2bit, y en vez de encender el deco cuando te lo pida el programa, hazlo simplemente enchufando a corriente en ese momento (aunque también pude ser que estés usando XP, en ese caso utiliza mejor el Sagem_Bk_20.exe con los bloques resultantes del PCLoader