Partiendo del supuesto de que tu finado padre y tu madre estaban en el régimen de gananciales, y que tu padre premurio a tu hermano, tendríamos la situación siguiente:
La mitad de los bienes del matrimonio eran de tu padre, y éste, se lo dejó a todos sus hijos por iguales partes. Excepto el usufructo, si es que se constituyó. que estaría a favor de tu madre.
La otra mitad de los bienes es de tu madre, que aún vive, y podrá disponer de ellos libremente y como desee: Enajenarlos, donarlos, o dejarlos en herencia. La ley no la impondrá ninguna condición para cualquiera de los dos primeros supuestos (excepto si hubiera hermanos tuyos menores o incapaces), pero para el caso testar, nombrando heredeross, es necesario tener en cuenta una figura legal que se denomina la “
legítima” .
La herencia se divide en tres partes. Una de ellas forma la
legítima estricta y se reparte entre los hijos a partes iguales. Si alguno de ellos ha fallecido, (como en tu caso) heredan sus descendientes por derecho de representación (es decir tus sobrinos).
Otra parte constituye el "
tercio de mejora" que se reparte también entre hijos y descendientes pero no necesariamente a partes iguales. Se puede beneficiar a unos hijos frente a otros, tal como tu madre pretende. Si no hay testamento, o éste no dice nada al respecto, el tercio de mejora se suma a la legítima y se reparte a partes iguales entre los hijos y descendientes.
Y el último tercio, llamado "
de libre disposición", el testador puede dejárselo a quien quiera, sea familiar, o no. Sobre esta parte puede decidir con absoluta libertad.
Tiene razón el Notario. Tu madre sólo puede disponer de la mitad de los bienes que había en el momento del fallecimiento de tu padre, el resto es de todos sus hijos o de sus descendientes a partes iguales. De su mitad, podrá mejorar la herencia sobre alguno de sus hijos, pero deberá respetar la “legítima”.
Salvo que haga una donación. . . 
Saludos y salvo mejor criterio.
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