Bufff, me temo que el problema de ALBERJ va a ser por los cables, o algo del hard, por que el programa en linux no me ha fallado ni una sola vez.
Yo utilizo un cable de 1 metro, y luego del adaptador jtag al deco un cable de cinta (como los de los discos duros, pero más chico) de apenas 10 cm.

Saludos.